C'est une histoire d'enfants qui trouvent avec l'aide d'animaux un peu d'argent pour acheter du lait pour leur mère malade. Le méchant joueur d'orgue de Barbarie, Brundibar, après les avoir une première fois chassés, vole les maigres économies des enfants qui se mettent à poursuivre le méchant homme : symbole poignant de l'oppression nazie.