Entrée à la Comédie-Française le 1er septembre 1989, Anne Kessler est nommée 488e sociétaire le 1er janvier 1994.
Elle y a notamment interprété Suzanne dans Le Mariage de Figaro de Beaumarchais mis en scène par Christophe Rauck, Maria Légorovna Bortsova dans Sur la grand-route de Tchekhov mis en scène par Guillaume Gallienne, le Tire-Laine, la Duègne, Cadet, une sœur dans Cyrano de Bergerac de Rostand mis en scène par Denis Podalydès, Gasparina dans Il campiello de Goldoni mis en scène par Jacques Lassalle, le Chœur dans Les Bacchantes d’Euripide mises en scène par André Wilms, Axioucha dans La Forêt d’Ostrovski mise en scène par Piotr Fomenko, Maria Efimovna Grékova dans Platonov de Tchekhov mis en scène par Jacques Lassalle, Paulina dans Le Conte d’hiver de Shakespeare mis en scène par Muriel Mayette, Clotilde Pontagnac dans Le Dindon de Feydeau mis en scène par Lukas Hemleb, Angélique dans George Dandin de Molière mis en scène par Catherine Hiegel, Ania dans La Cerisaie de Tchekhov mise en scène par Alain Françon, Antigone dans La Thébaïde de Racine mise en scène par Yannis Kokkos, Hedvig dans Le Canard sauvage d’Ibsen mis en scène par Alain Françon, Rosaura dans La Serva amorosa de Goldoni mise en scène par Jacques Lassalle, Rosine dans Le Barbier de Séville de Beaumarchais mis en scène par Jean-Luc Boutté.
En 2002, elle présente Serge Gainsbourg : Poèmes et chansons au Studio-Théâtre dans le cadre des propositions de la Comédie-Française et met en scène en 2006 au Studio-Théâtre Griefs, à partir de textes de Strindberg, Ibsen et Bergman et Trois hommes dans un salon d’après l’interview de Brel, Brassens, Ferré par François-René Cristiani ; le 3 janvier 2007 à la Salle Richelieu elle a mis en espace avec Guy Zilberstein la soirée d’hommage à Catherine Samie pour ses 50 ans de maison, Jubilé jubilant.