D’abord aux côtés d’Antoine Vitez tout au long de l’aventure du Théâtre National de Chaillot, il suivra Christian Schiaretti à la Comédie de Reims en 1990, non sans avoir collaboré durant deux ans à Théâtre Ouvert auprès de Micheline et Lucien Attoun. En 1996, il ouvre la Scène nationale de Clermont-Ferrand puis devient Secrétaire général de la Comédie-Française (2001-2007). Il y mettra en voix et en espace les oeuvres d’auteurs aussi divers que Césaire, Dante, Hugo, Rimbaud, Roubaud, Senghor, Yacine...
Depuis 2007, Jean-Pierre Jourdain oeuvre auprès de Christian Schiaretti en qualité de directeur artistique du TNP. Il est également l’auteur de plusieurs pièces et adaptations théâtrales, dont Armance de Stendhal, Fille du ciel et de la terre d’après Jeanne d’Arc de Joseph Delteil, créée en 1995 à la Comédie de Reims, avec Camille Grandville.