Après des études à l'Ecole du Théâtre National de Strasbourg et un premier spectacle au Théâtre de la Cité Internationale (Lotte à Weimar d'après Thomas Mann en 1981), Jean-Claude Berutti commence un parcours en solitaire qui le mène de la Belgique à l'URSS en passant par la Hollande et l'Allemagne, pays où il se forme en travaillant autant dans des théâtres modestes que sur les grandes scènes.

Il connaît ainsi la vie de troupe du Théâtre d'Etat de Vologda (Les Fourberies de Scapin en 1990), mais aussi les conditions exceptionnelles de théâtres comme La Monnaie à Bruxelles (Louise en 1983, Manfred en 1993) ou l'Opéra de Lyon (Faust en 2000, Rusalka en 2001) ou l'Opéra de Nancy (Le Roi Candaule en 2005). Mais c'est au Théâtre National de Belgique qu'il travaille régulièrement de 1995 à 2001 (Le Médecin malgré lui, Caprices d'Images de Paul Emond, Le Cocu magnifique) et noue une amitié indéfectible avec les comédiens de la Communauté Française.

En 1997, il est nommé directeur du Théâtre du Peuple à Bussang dont il développe l'activité artistique tout en y imposant de façon pérenne le répertoire contemporain (Le Pupitre veut être tuteur de Peter Handke en 2000 et La Chute de Biljana Srbljanovic en 2001).

Depuis 2002, il dirige, avec François Rancillac, La Comédie de Saint-Etienne, centre dramatique national, et son Ecole. Ensemble, ils tentent de redonner sens aux principes de son fondateur Jean Dasté. Grâce à la présence permanente de comédiens, ils font de l'élargissement du public leur priorité en reprenant les chemins de la Loire et de la Haute-Loire, mais aussi ceux des quartiers populaires de la Ville. Jean-Claude Berutti crée ainsi La Cantatrice chauve (2003) pour la "Comédie des champs" et Occupations de Salomé Broussky (2005) pour la "Comédie des villes". Mais outre ces spectacles de proximité, il met en scène La Gonfle de Roger Martin du Gard, Ruzante (avec Bruno Putzulu), Zelinda et Lindoro d'après Goldoni, qui tournent en France et en Europe.

Depuis novembre 2005, Jean-Claude Berutti est président de la Convention Théâtrale Européenne, réseau qui regroupe 34 théâtres de troupe à travers le continent.

Invité par la Comédie Française, il créera Les Temps difficiles de Edouard Bourdet, en novembre 2006 au Théâtre du Vieux Colombier.

Au printemps 2007, il a mis en scène L'Elixir d'amour à l'Opéra de Leipzig. Il partira cet automne en Afrique pour la tournée de Catharsis, nouvelle pièce du jeune auteur togolais Gustave Akakpo créée en octobre 2006 aux Francophonies de Limoges.